梅雨墨当上了皇帝，但大清并没有因此富强，列强对大清的倾吞之心越发强烈，所以年轻的皇帝，举办了一场万狮朝圣的盛典彰显国力，向各国列强摊派但没想到在盛典上爆发奇怪的瘟疫。经查核瘟疫之源竟是阳城县。皇帝担心曾经的红颜白雪晴出事，也想查清瘟疫根源，再次化名梅雨墨出宫查案。命运弄人，白雪晴也为了查清瘟疫之事来到了京城，两人就在这瘟疫乱世中再次相遇。还结识了日本来的也说要查自己失踪爷爷的小女孩。秦三川和老仇人佟安再次相见，仇恨的火花四起，得到名份得不到爱情的娜仁托亚与六贝勒的纠葛，多角恋的旧情新案，这背后是一件件离奇的案件，一段段警示的恋情，而真相有些他们料到，有些万万没想到......《大清神捕第2季》的剧本精炼紧凑，剧中场景弥漫着青春的气息，风格轻巧，该剧最大的看点就是精心布局的悬念，该剧用年轻人喜闻乐见的叙事方式，将东方审美融入剧情内容，实现了传统文化的影视化表达，让用户在观看故事剧情的同时，更好地感受到传统文化的魅力。