“多元信仰私立高中”是一所真正的“混球高中”，英语老师沾染性病后全班落荒而逃——因为学生之间混乱的关系让每个人都感到杯弓蛇影，而这不过是混球高中乱象的冰山一角。因学生不认可韩国文化的老师大感内疚，要求女生们殴打自己上演了教室求爱的好戏；被贫穷小鬼附身的贫穷少女（金玉彬 饰）要靠出卖身体赚钱，母亲则落入了直销骗局，贫穷少女深深迷恋来自瑞士的学生安素尼（朴镇宇 饰），可后者完全无视她；班中唯一的处男——独眼龙却有一个美艳的弟弟“双眼”，安素尼对双眼一见钟情，可是始终不能突破性别的障碍，陷入了痛苦的单恋。贫穷少女因无力偿债被介绍给异装癖的黑道社长，二人居然结为亲昵的姐妹，一次出游时，他们被性爱教徒绑架，贫穷少女被迫热舞，在视频上传网络后意外大热，这令安素尼开始留意她……《多细胞少女》是部设定相当疯狂的动画片，观众可从中观察到弱肉强食的社会也可看到不忘初心的那份勇敢。《多细胞少女》完美的诠释了人该如何面对自我，营造了一个乌托邦式的社会，这部动画是导演最出色的佳作。故事简单而深刻，传递着最为真挚的情感，《多细胞少女》有着对爱的探讨，童稚之爱的原则是：“因为我爱，所以我爱。”成熟之爱的原则是：“因为我爱，所以我被爱”。侧面反映出了勇敢的品质会得到奇异世界的尊重。